More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1768 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1680  putative PAS/PAC sensor protein  66.78 
 
 
879 aa  1204    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.85517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2889  sensory box histidine kinase  61.93 
 
 
869 aa  1120    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1812  multi-sensor signal transduction histidine kinase  98.86 
 
 
878 aa  1785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.886471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
870 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0842783  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.29 
 
 
872 aa  1138    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.18 
 
 
872 aa  1135    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  98.75 
 
 
878 aa  1785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.826107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.29 
 
 
872 aa  1151    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2510  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  99.32 
 
 
876 aa  1792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.459167  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1768  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
878 aa  1805    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.760455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2472  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 
866 aa  625  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2065  putative PAS/PAC sensor protein  38.39 
 
 
872 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768773  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2218  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.46 
 
 
879 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.116111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1955  sensory box histidine kinase  36.65 
 
 
849 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.941314  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  30.31 
 
 
921 aa  213  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0569  GGDEF domain-containing protein  28.18 
 
 
678 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 
665 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0770699  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.17 
 
 
665 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 
665 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 
665 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00274337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  26.02 
 
 
785 aa  134  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
785 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.47 
 
 
661 aa  126  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  31.91 
 
 
806 aa  91.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
806 aa  89.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
2077 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  32.86 
 
 
671 aa  87.8  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  24.53 
 
 
770 aa  87.8  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 
1254 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
3706 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
1741 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.75 
 
 
1015 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  33.12 
 
 
736 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
2693 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.35 
 
 
1355 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 
898 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.32 
 
 
1453 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  27.59 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
1959 aa  77.8  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 
714 aa  77  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
885 aa  77.4  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.22 
 
 
1165 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 
900 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
637 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.95 
 
 
1561 aa  75.1  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
901 aa  75.1  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
893 aa  75.1  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
1205 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
893 aa  73.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  22.52 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.51 
 
 
603 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 
683 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 
900 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1168 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.36 
 
 
599 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
655 aa  71.6  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.1 
 
 
1284 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.21 
 
 
789 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  20.43 
 
 
771 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.95 
 
 
1135 aa  67.8  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.27 
 
 
934 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
842 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.76 
 
 
881 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.702942  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
986 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
862 aa  65.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.56 
 
 
1442 aa  65.1  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.23 
 
 
842 aa  65.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
677 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.77 
 
 
1211 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  22.14 
 
 
2213 aa  64.3  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
644 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1344 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  28.86 
 
 
433 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 
511 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.82 
 
 
678 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.09 
 
 
689 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
690 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 
788 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.08 
 
 
717 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.95 
 
 
1316 aa  62.4  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.33 
 
 
677 aa  62  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.82 
 
 
488 aa  62  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 
991 aa  61.6  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.3 
 
 
1180 aa  61.6  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 
853 aa  61.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.9 
 
 
982 aa  61.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 
590 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
670 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  19.44 
 
 
772 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
559 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0532  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.75 
 
 
814 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  27.5 
 
 
794 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1530  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.5 
 
 
896 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
453 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.61 
 
 
590 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.63 
 
 
673 aa  59.7  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1090 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1090 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  31.06 
 
 
737 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
821 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>