More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0569 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0569  GGDEF domain-containing protein  100 
 
 		 678 aa  1407    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  32.38 
 
 		 921 aa  359  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2472  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 		 866 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 870 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0842783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1768  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 878 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.760455  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 785 aa  205  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  29.34 
 
 		 785 aa  203  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2510  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 876 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.459167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2889  sensory box histidine kinase  27.18 
 
 		 869 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 878 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.826107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1812  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 878 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.886471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 872 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 872 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 872 aa  193  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1680  putative PAS/PAC sensor protein  27.18 
 
 		 879 aa  193  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.85517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2218  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.35 
 
 		 879 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  40.44 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2065  putative PAS/PAC sensor protein  27.25 
 
 		 872 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  42.72 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41 
 
 		 960 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  42.72 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.81 
 
 		 353 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  32.18 
 
 		 591 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 665 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0770699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 		 665 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.14 
 
 		 665 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 		 665 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00274337  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  45.65 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3819  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 660 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.74 
 
 		 661 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 		 1637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  39.78 
 
 		 410 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3770  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 660 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1974  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.64 
 
 		 340 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.098619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.27 
 
 		 338 aa  156  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.29 
 
 		 352 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 641 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.34 
 
 		 890 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.78 
 
 		 890 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  41.63 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.63 
 
 		 372 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  41.75 
 
 		 339 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 327 aa  154  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0709  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.24 
 
 		 322 aa  153  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.169559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  39.88 
 
 		 323 aa  153  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  42.2 
 
 		 328 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.24 
 
 		 481 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0754  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.15 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.17 
 
 		 345 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  38.53 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.24 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  44.12 
 
 		 335 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  43.89 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 337 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.35 
 
 		 664 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  38.73 
 
 		 1629 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  42.19 
 
 		 510 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1949  sensory box/GGDEF family protein  40.33 
 
 		 579 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.773832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  43.5 
 
 		 553 aa  151  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 547 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 487 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 		 487 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 		 487 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  42.41 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 487 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 487 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 487 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.49 
 
 		 308 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.79 
 
 		 362 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 340 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  41.42 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  38.5 
 
 		 344 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 538 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  42.13 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  44.32 
 
 		 1262 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.32 
 
 		 734 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 340 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  40.66 
 
 		 630 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  37.62 
 
 		 340 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.2 
 
 		 341 aa  147  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  42.31 
 
 		 492 aa  147  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  43.16 
 
 		 507 aa  147  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  37.63 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0411  PAS:GGDEF  41.98 
 
 		 317 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  37.62 
 
 		 340 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  36.44 
 
 		 641 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.27 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  38.16 
 
 		 347 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29300  Response regulator  41.38 
 
 		 310 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  37.56 
 
 		 536 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3843  diguanylate cyclase  39.57 
 
 		 472 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 359 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2499  GGDEF domain-containing protein  40.7 
 
 		 367 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0945  diguanylate cyclase  37.56 
 
 		 463 aa  145  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>