More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1680 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2889  sensory box histidine kinase  64.52 
 
 
869 aa  1174    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1812  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 
878 aa  1204    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.886471 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.32 
 
 
878 aa  1204    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.826107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.9 
 
 
872 aa  1188    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
870 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0842783  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1768  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.78 
 
 
878 aa  1213    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.760455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.47 
 
 
872 aa  1191    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.59 
 
 
872 aa  1191    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2510  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  66.71 
 
 
876 aa  1209    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.459167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1680  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
879 aa  1813    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.85517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2472  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 
866 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2065  putative PAS/PAC sensor protein  37.05 
 
 
872 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768773  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2218  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.05 
 
 
879 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.116111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1955  sensory box histidine kinase  37.43 
 
 
849 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.941314  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  28.72 
 
 
921 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0569  GGDEF domain-containing protein  27.09 
 
 
678 aa  187  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 
661 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
665 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0770699  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.18 
 
 
665 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
665 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00274337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
665 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  24.05 
 
 
785 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
785 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
806 aa  104  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
806 aa  92.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 
2077 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.18 
 
 
1254 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  23.32 
 
 
770 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  23.96 
 
 
663 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  32.39 
 
 
736 aa  81.3  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  33.79 
 
 
671 aa  80.9  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 
3706 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 
898 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  22.17 
 
 
771 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.34 
 
 
1015 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.59 
 
 
1355 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  20.19 
 
 
2213 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
1168 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.4 
 
 
1135 aa  67.8  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1959 aa  67.8  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.44 
 
 
714 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
2693 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
637 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  23.61 
 
 
548 aa  64.7  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1205 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.67 
 
 
683 aa  63.9  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 
862 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  21.28 
 
 
772 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.79 
 
 
603 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  19.48 
 
 
1165 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.82 
 
 
785 aa  62.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.3 
 
 
982 aa  62.4  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 
630 aa  62  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.08 
 
 
881 aa  62  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.702942  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
1741 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 
1340 aa  61.6  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2629  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.34 
 
 
607 aa  61.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.06 
 
 
1561 aa  61.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.39 
 
 
1344 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.03 
 
 
599 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.07 
 
 
1466 aa  60.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.95 
 
 
900 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.44 
 
 
893 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0532  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.03 
 
 
814 aa  60.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  21.14 
 
 
1453 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 
1245 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  21.12 
 
 
630 aa  59.7  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.67 
 
 
900 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1343  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.07 
 
 
859 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0844288  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.71 
 
 
1066 aa  59.3  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  26.67 
 
 
794 aa  59.3  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
655 aa  59.3  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.71 
 
 
901 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.83 
 
 
678 aa  58.9  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  20.87 
 
 
630 aa  58.9  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
962 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.8 
 
 
991 aa  58.9  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.01 
 
 
1177 aa  58.9  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25 
 
 
784 aa  58.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25 
 
 
786 aa  58.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 
1452 aa  58.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
590 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  22.45 
 
 
691 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22 
 
 
1004 aa  57  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.27 
 
 
1331 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.91 
 
 
1253 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0505  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.63 
 
 
952 aa  56.2  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1530  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.74 
 
 
896 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
690 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 
885 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.22 
 
 
789 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1068 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 
1303 aa  55.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2112  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.2 
 
 
836 aa  55.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  25.83 
 
 
433 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
590 aa  55.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 
842 aa  55.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
986 aa  55.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.08 
 
 
1284 aa  55.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.89 
 
 
689 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>