More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1632 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2889  sensory box histidine kinase  81.72 
 
 		 869 aa  1430    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1768  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.29 
 
 		 878 aa  1163    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.760455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.83 
 
 		 878 aa  1155    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.826107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1812  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.95 
 
 		 878 aa  1154    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.886471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2510  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.06 
 
 		 876 aa  1161    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.459167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1680  putative PAS/PAC sensor protein  65.9 
 
 		 879 aa  1193    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.85517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 870 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0842783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  93.23 
 
 		 872 aa  1613    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  93.69 
 
 		 872 aa  1623    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 872 aa  1782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2472  putative PAS/PAC sensor protein  35.78 
 
 		 866 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2065  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 872 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2218  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.99 
 
 		 879 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1955  sensory box histidine kinase  36.1 
 
 		 849 aa  499  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.941314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  31.19 
 
 		 921 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0569  GGDEF domain-containing protein  26.81 
 
 		 678 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729555  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 785 aa  129  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 		 665 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0770699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.37 
 
 		 665 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 		 665 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00274337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 		 665 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  23.64 
 
 		 785 aa  122  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 661 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 806 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  22.36 
 
 		 893 aa  94  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 898 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  25.72 
 
 		 770 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 806 aa  91.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.62 
 
 		 1254 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.46 
 
 		 900 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  33.13 
 
 		 2077 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  22.51 
 
 		 663 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 		 901 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.78 
 
 		 885 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.96 
 
 		 900 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 		 893 aa  85.9  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  28.12 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  29.52 
 
 		 1135 aa  84.7  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  38.26 
 
 		 736 aa  84.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 1211 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.71 
 
 		 1355 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  24.9 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.09 
 
 		 1015 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  25.76 
 
 		 771 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 779 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.4 
 
 		 1453 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 3706 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.65 
 
 		 1165 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  27.19 
 
 		 657 aa  73.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 1741 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 714 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 670 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3685  histidine kinase  22.39 
 
 		 708 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 2693 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 690 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  21.08 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  26.07 
 
 		 1250 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  21.31 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  19.72 
 
 		 982 aa  69.3  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 842 aa  68.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.41 
 
 		 1284 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  21.86 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.25 
 
 		 779 aa  68.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 862 aa  67.8  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1959 aa  67.8  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.67 
 
 		 881 aa  67.8  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.702942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0835  two component system histidine kinase  22.03 
 
 		 831 aa  67  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 		 590 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  24.92 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1160  putative sensor protein gacS  21.25 
 
 		 808 aa  67  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 		 433 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 701 aa  67  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 1166 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  22.61 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 1205 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.86 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.21 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.63 
 
 		 2213 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 1242 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  23.93 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  21.22 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 854 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  24.1 
 
 		 950 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1068 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 1166 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 453 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 637 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.01 
 
 		 678 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 673 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>