More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3221 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  92.37 
 
 
590 aa  1111    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
590 aa  1220    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
986 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
983 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
578 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1303  methyl-accepting chemotaxis protein  47.12 
 
 
494 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  52.94 
 
 
533 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
871 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
533 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.98 
 
 
533 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
854 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
621 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
916 aa  160  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 
823 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  29.72 
 
 
1439 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3923  sensory box protein  43.59 
 
 
297 aa  150  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
1340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
737 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
511 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2151  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 
707 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
1622 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
619 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
639 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
639 aa  135  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.89 
 
 
929 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
781 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
842 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
696 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.7 
 
 
1021 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
830 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
1428 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  45.86 
 
 
420 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1019 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
532 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
639 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  47.11 
 
 
419 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
631 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1977  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.69 
 
 
311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000486076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
1116 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
839 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710267  hitchhiker  0.00000913845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3843  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50 
 
 
407 aa  126  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000804532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
572 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 
1177 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  44.6 
 
 
783 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  28.23 
 
 
1030 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
984 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  26.48 
 
 
673 aa  124  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  28.42 
 
 
613 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 
1331 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  28.28 
 
 
1209 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
934 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
444 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1435  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
1191 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0537  sensory box/GGDEF family protein  42.03 
 
 
682 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
680 aa  120  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
841 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310558  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.47 
 
 
1453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
572 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
637 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1391 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.54 
 
 
619 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.5 
 
 
431 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
515 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.71 
 
 
431 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 
1611 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1165 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  25.71 
 
 
661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  45 
 
 
815 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  29.46 
 
 
676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
802 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
1140 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0987  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
451 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
827 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
680 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.81 
 
 
1331 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
619 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.16 
 
 
785 aa  113  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  28.39 
 
 
1215 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
1134 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
877 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  27.34 
 
 
1213 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  39.33 
 
 
1210 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1260 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
729 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.401412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
1060 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  27.79 
 
 
1206 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 
614 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
636 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  26.15 
 
 
1211 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>