281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2472 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2472  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
866 aa  1767    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
870 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0842783  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2065  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
872 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768773  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2510  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
876 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.459167  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
878 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.826107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1768  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
878 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.760455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1812  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
878 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.886471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2889  sensory box histidine kinase  36.43 
 
 
869 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1680  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 
879 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.85517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
872 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
872 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
872 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2218  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.64 
 
 
879 aa  547  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.116111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1955  sensory box histidine kinase  34.07 
 
 
849 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.941314  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0569  GGDEF domain-containing protein  32.47 
 
 
678 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  31.05 
 
 
921 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 
665 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0770699  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.2 
 
 
665 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 
665 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00274337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 
665 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
785 aa  154  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  25.36 
 
 
785 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 
661 aa  129  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  38.58 
 
 
806 aa  90.1  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  25.06 
 
 
770 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 
2077 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
806 aa  84.7  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
736 aa  83.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  23.15 
 
 
771 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  28 
 
 
663 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.04 
 
 
1453 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
2693 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
637 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.09 
 
 
1230 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.17 
 
 
1015 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.13 
 
 
682 aa  70.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
1205 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 
655 aa  68.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.97 
 
 
717 aa  68.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 
644 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.54 
 
 
881 aa  66.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.702942  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1167 aa  65.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
929 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  19.96 
 
 
1234 aa  64.7  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.3 
 
 
873 aa  64.3  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  25 
 
 
671 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.99 
 
 
678 aa  63.9  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
683 aa  63.9  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
3706 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0505  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.93 
 
 
952 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.88 
 
 
714 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
1428 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
1168 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
1059 aa  61.6  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1236 aa  61.2  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.08 
 
 
785 aa  60.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  25.61 
 
 
637 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
805 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.16 
 
 
789 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.15 
 
 
965 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  25.19 
 
 
1561 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.01 
 
 
1078 aa  58.9  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25 
 
 
599 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  21.75 
 
 
632 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  25.83 
 
 
548 aa  58.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.68 
 
 
779 aa  58.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.24 
 
 
1355 aa  57.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 
559 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.28 
 
 
1344 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.26 
 
 
789 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
488 aa  56.6  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
1741 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.18 
 
 
1233 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 
865 aa  56.2  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.23 
 
 
658 aa  55.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1177 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1234 aa  55.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
1254 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
968 aa  55.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
842 aa  54.7  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  21.57 
 
 
644 aa  54.7  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
986 aa  54.7  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1238 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1238 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1238 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1238 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.37 
 
 
603 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.95 
 
 
784 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  25.77 
 
 
1765 aa  54.3  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  25.64 
 
 
955 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
737 aa  53.9  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
1188 aa  53.5  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.03 
 
 
1959 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.1 
 
 
905 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2918  Cache sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
779 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1236 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1236 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.33 
 
 
893 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1236 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1245 aa  52.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>