More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3513 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3513  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
585 aa  1117    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.48 
 
 
557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
644 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 
562 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
563 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 
563 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 
689 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  38.94 
 
 
565 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
563 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 
563 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 
656 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 
686 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  40.59 
 
 
682 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 
714 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 
563 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 
565 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 
564 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
690 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 
573 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 
565 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.36 
 
 
567 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
681 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  43.55 
 
 
676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  43.3 
 
 
691 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 
563 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
688 aa  233  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
688 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
651 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3409  chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
651 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304746  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 
566 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
563 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
602 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
675 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 
655 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.87 
 
 
542 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.16 
 
 
716 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
561 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  32.81 
 
 
561 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
568 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 
563 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
555 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0796423  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
566 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
608 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
561 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 
563 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 
561 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.04 
 
 
567 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 
656 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
563 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
561 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
563 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
563 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
667 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
681 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
568 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
567 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
566 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
674 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
563 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.9 
 
 
691 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 
561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
655 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
587 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4246  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  43.05 
 
 
689 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
673 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
656 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 
563 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 
561 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.66 
 
 
558 aa  223  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 
561 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
698 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 
656 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  42.9 
 
 
707 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
669 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
688 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
562 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.64 
 
 
691 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 
563 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 
586 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.15 
 
 
568 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  39.8 
 
 
688 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
688 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  40.21 
 
 
698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 
561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 
567 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 
561 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
641 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 
651 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
670 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
674 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
662 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 
556 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
558 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
566 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>