More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1573 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  100 
 
 
283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6930  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.06 
 
 
211 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.98 
 
 
212 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  35.57 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
208 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11833  transcriptional regulator, Crp family protein  31.96 
 
 
208 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3649  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.46 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111908  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
228 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0203  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
221 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
216 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
220 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  31.28 
 
 
201 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
235 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0022  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
229 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1260  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.02 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.22 
 
 
223 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.68 
 
 
229 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
224 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1158  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  30.41 
 
 
224 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.706158  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
218 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
218 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2521  transcriptional regulator  26.55 
 
 
225 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0399516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.25 
 
 
223 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
240 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
224 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
224 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1507  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.75 
 
 
227 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00368382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
219 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.18 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.25 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
231 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  24.37 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  27.75 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  26.02 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  26.97 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
233 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
233 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
232 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  26.42 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.49 
 
 
225 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.47 
 
 
231 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
218 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  28.36 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  24.75 
 
 
218 aa  62.4  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 
216 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  25.26 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.71 
 
 
220 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  24.75 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  24.87 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  23.47 
 
 
214 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
225 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  24.35 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  24.35 
 
 
214 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
236 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
235 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
228 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  22.05 
 
 
240 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  24.5 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.76 
 
 
212 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0550  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.57 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  24.74 
 
 
214 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  24.23 
 
 
214 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
236 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 
219 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 
214 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.94 
 
 
229 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 
229 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.36 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
229 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5519  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  0.190361 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
231 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
235 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  23.41 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.72 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>