145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11833 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11833  transcriptional regulator, Crp family protein  100 
 
 		 208 aa  433  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.55 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6930  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.57 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  45.59 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.3 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3649  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.25 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.28 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2521  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0399516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0203  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1260  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1158  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 224 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1507  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.22 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00368382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3266  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0022  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.04 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.93 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.706158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.51 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.39 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.51 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  24.24 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.9 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  22.64 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.69 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  22.7 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  22.47 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  23.98 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.17 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  22.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  22.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  22.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  22.95 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  22.03 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  22.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  22.94 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  22.4 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2528  putative transcriptional regulator  20.3 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.05 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  20.22 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  22.95 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  21.86 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  21.31 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  21.31 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  21.86 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  21.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  22.68 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  22.03 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.78 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  20.22 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  21.86 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.29 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.78 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>