181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12618 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11833  transcriptional regulator, Crp family protein  45.59 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.18 
 
 
212 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6930  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45 
 
 
211 aa  180  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  35.57 
 
 
283 aa  155  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
208 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.59 
 
 
212 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
228 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.33 
 
 
223 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0203  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
247 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3649  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.64 
 
 
222 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111908  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2521  transcriptional regulator  27.55 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0399516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.25 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  27.53 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1260  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.75 
 
 
230 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3266  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  28.31 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1158  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0022  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.706158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1507  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00368382  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.58 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  25.25 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.32 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
238 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0550  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.04 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.59 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.75 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.2 
 
 
232 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  24.86 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.55 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.55 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
244 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.75 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  25 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.15 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2689  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.99 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.13 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.5 
 
 
243 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.7 
 
 
243 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.31 
 
 
232 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.79 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.5 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  22.22 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.96 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  20.3 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.4 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.71 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
222 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.51 
 
 
238 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.65 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.26 
 
 
225 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.71 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  22.06 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.76 
 
 
212 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  22.87 
 
 
217 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 
237 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.56 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.39 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  22.7 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  21.57 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3110  cyclic nucleotide-binding protein  19.19 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.71 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.58 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  24.19 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.51 
 
 
238 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>