209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6174 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6930  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  76.3 
 
 		 211 aa  343  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11833  transcriptional regulator, Crp family protein  47.55 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  45.18 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 283 aa  158  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.44 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.15 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3649  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.94 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.17 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2521  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0399516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  28.65 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1260  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0203  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 247 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4775  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1158  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.25 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.57 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3266  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0022  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1507  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.77 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00368382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.706158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  24.1 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.22 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.74 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.04 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3715  cAMP-regulatory protein  27.07 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.088887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0792  cAMP-regulatory protein  25.97 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0879  cAMP-regulatory protein  25.41 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000144762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.79 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.79 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.16 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  26.74 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04006  cAMP-regulatory protein  25.81 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.84 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  26.29 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  27.22 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.44 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  25.27 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.5 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.31 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  27.72 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  24.86 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>