215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0784 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.706158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
235 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  34 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
240 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
224 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 
229 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3649  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.71 
 
 
222 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111908  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  29.38 
 
 
283 aa  88.2  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1260  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.24 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0022  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3266  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  30.43 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1507  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00368382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1158  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  27.16 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  27.22 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0203  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.15 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2521  transcriptional regulator  24.22 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0399516 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6930  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 
229 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11833  transcriptional regulator, Crp family protein  22.93 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.39 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.68 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.92 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  29.79 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.22 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  23.76 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.41 
 
 
226 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  22.91 
 
 
224 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.35 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.38 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  23.43 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  27.85 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.6 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
229 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.98 
 
 
222 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 
230 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
234 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.91 
 
 
228 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.77 
 
 
218 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  26.37 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.71 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  26.37 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.54 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.72 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  23.64 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  23.84 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.09 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4494  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.164578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.53 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.09 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.69 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.03 
 
 
222 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  25.13 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  23.81 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1233  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.88 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0234193  normal  0.501568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  22.84 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
241 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0878  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.24 
 
 
257 aa  48.5  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  20.79 
 
 
217 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.38 
 
 
229 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  24.18 
 
 
244 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  21.35 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
244 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
244 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0244  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.23 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  22.84 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.55 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0827  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.81 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0664388  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.75 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.57 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.75 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>