154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6930 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6930  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  76.3 
 
 		 212 aa  343  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11833  transcriptional regulator, Crp family protein  46.57 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  45 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.98 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1245  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.21 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1260  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3649  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.09 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  28.65 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2521  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0399516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.15 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0203  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1158  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4775  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3266  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0022  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1507  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00368382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.706158  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  24.23 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.51 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.76 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  25.13 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  26.32 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  28.88 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  31.09 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.86 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  29.12 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.84 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.65 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  29.73 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  30.37 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.03 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.03 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  28.11 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.43 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.03 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3715  cAMP-regulatory protein  25.27 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.088887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.59 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  30.39 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  30.39 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.32 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>