217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3898 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  94.86 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.95 
 
 		 263 aa  314  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 269 aa  305  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1880  regulatory protein Crp  59.75 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5519  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  0.190361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0645  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526401  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0555  transcriptional regulatory protein  42.36 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0885845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0252  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1183  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.17 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0654  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0432804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  40.09 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  37.89 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.45 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  37.89 
 
 		 255 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.34 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  36.73 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.78 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.4 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.4 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.89 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  34.32 
 
 		 439 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  34.38 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.97 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4396  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  34.5 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  34.62 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  37.44 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  33.48 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  33.48 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 		 338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  34.67 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  39.45 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  34.22 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3375  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.44 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  32.22 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  33.19 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.16 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>