182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5841 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 244 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.67 
 
 		 244 aa  342  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 244 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 267 aa  321  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.11 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  60 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.2 
 
 		 239 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  60.35 
 
 		 239 aa  284  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.33 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.89 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.47 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.19 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  56.7 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 246 aa  248  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  51.42 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  51.42 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  51.42 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  51.42 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  51.42 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  51.42 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  51.43 
 
 		 344 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.55 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  51.01 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  51.11 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  51.11 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  50.43 
 
 		 439 aa  241  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  54.91 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.79 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.52 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 340 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  47.32 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  43.17 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.17 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.81 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.84 
 
 		 260 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 262 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.95 
 
 		 338 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  37.87 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  41.26 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  37.95 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  38.05 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  36.36 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  37.61 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.41 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>