177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1943 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.95 
 
 
262 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  54.79 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
260 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
260 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  54.41 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  54.41 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  54.41 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.63 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  51.05 
 
 
264 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.03 
 
 
244 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
244 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  39.65 
 
 
242 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
244 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  37.75 
 
 
312 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  33.91 
 
 
255 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
267 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  37.75 
 
 
344 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
267 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  33.91 
 
 
255 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
240 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.33 
 
 
243 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
250 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
238 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 
238 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
232 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
260 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.62 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
260 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
260 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
239 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
239 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
239 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
232 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
247 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
239 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
246 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
239 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
239 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
244 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.51 
 
 
239 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
239 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
244 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.56 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
239 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
239 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
239 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  33.89 
 
 
439 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  35.56 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
255 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
255 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  34.67 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 
242 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  30.87 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  31.76 
 
 
246 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.76 
 
 
246 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
242 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
340 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  30.09 
 
 
230 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.4 
 
 
338 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.42 
 
 
265 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
269 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.8 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
251 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4529  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
258 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0459057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>