181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0821 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  97.44 
 
 
344 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  99.63 
 
 
269 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  70.59 
 
 
260 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  70.17 
 
 
260 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  67.07 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.75 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.75 
 
 
260 aa  324  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.75 
 
 
260 aa  324  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.75 
 
 
260 aa  324  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.04 
 
 
244 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.2 
 
 
244 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.2 
 
 
244 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
267 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
267 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.68 
 
 
240 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  51.42 
 
 
242 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.3 
 
 
238 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
238 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.42 
 
 
239 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
247 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
243 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
243 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
243 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.12 
 
 
254 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.76 
 
 
239 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
239 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
239 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
239 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
239 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.68 
 
 
240 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
239 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.6 
 
 
239 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
250 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.16 
 
 
239 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.5 
 
 
244 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.81 
 
 
246 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.52 
 
 
232 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  48.25 
 
 
255 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  44.84 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.09 
 
 
232 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
232 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.23 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.9 
 
 
243 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
245 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
239 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  45.38 
 
 
439 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.83 
 
 
236 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
244 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
263 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  45.61 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  45.64 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.63 
 
 
246 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  41.63 
 
 
246 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.83 
 
 
340 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.54 
 
 
242 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.83 
 
 
255 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
340 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  43.61 
 
 
234 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  41.74 
 
 
242 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.42 
 
 
260 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.21 
 
 
245 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
255 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
262 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
248 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
260 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
260 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  40.57 
 
 
259 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  37.17 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
258 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  38.5 
 
 
238 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
232 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.72 
 
 
247 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  36.24 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.04 
 
 
338 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.76 
 
 
256 aa  148  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
251 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
231 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  34.93 
 
 
230 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>