183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1631 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  513  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  85.53 
 
 		 236 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  77.64 
 
 		 252 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  43.58 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  41.78 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.47 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.53 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.86 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.52 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  37.89 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.73 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  36.64 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.06 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.84 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1880  regulatory protein Crp  42.06 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  38.14 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.27 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  37.44 
 
 		 344 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  38.56 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.56 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35.4 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  37.27 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  34.18 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.18 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.14 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  33.47 
 
 		 439 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  40.62 
 
 		 274 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 340 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4396  cyclic nucleotide-binding protein  38.07 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  34.96 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  35.22 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5519  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  0.190361 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.04 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.05 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0519  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  34.67 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  34.38 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  37.61 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>