235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4415 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.79 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  47.79 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.23 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.78 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1183  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.78 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1880  regulatory protein Crp  45.41 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5519  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  0.190361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0645  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0252  transcriptional regulator  41.6 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0555  transcriptional regulatory protein  42.22 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0885845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 239 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0654  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0432804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.05 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  39.83 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  40.09 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  38.94 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 340 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.14 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.74 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.82 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4763  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.34 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.29 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.05 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35.56 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  37.34 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  37.34 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  37.34 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  37.34 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  37.34 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  37.34 
 
 		 312 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  36.91 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.52 
 
 		 338 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  36.91 
 
 		 344 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  36.89 
 
 		 439 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4396  cyclic nucleotide-binding protein  38.16 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  36.64 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  34.63 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3900  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.43 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  34.76 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  36.28 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0519  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  36.12 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0075  hypothetical protein  37.61 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.39 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>