186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5269 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
340 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  90.29 
 
 
340 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
242 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.39 
 
 
338 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.83 
 
 
239 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.83 
 
 
239 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.98 
 
 
239 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
239 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
239 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.72 
 
 
243 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.98 
 
 
239 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.98 
 
 
239 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.72 
 
 
243 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.72 
 
 
243 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
239 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.78 
 
 
239 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  69.2 
 
 
239 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.78 
 
 
239 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.08 
 
 
238 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.22 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.32 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  61.98 
 
 
255 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  62.55 
 
 
255 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
247 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.53 
 
 
240 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.34 
 
 
254 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.23 
 
 
246 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.81 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.03 
 
 
250 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.09 
 
 
232 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.64 
 
 
232 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  60.09 
 
 
232 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60 
 
 
246 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  55.51 
 
 
239 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.46 
 
 
244 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.46 
 
 
244 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.31 
 
 
236 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.59 
 
 
244 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  56 
 
 
274 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
267 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  58.02 
 
 
239 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  51.98 
 
 
439 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
268 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  50 
 
 
258 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.4 
 
 
263 aa  238  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
240 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  48.21 
 
 
242 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
255 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
244 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  48.67 
 
 
255 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.88 
 
 
243 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  43.61 
 
 
246 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.61 
 
 
246 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.18 
 
 
260 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
260 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
260 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  43.21 
 
 
344 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  41.83 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  44.54 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  44.54 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  44.54 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  44.54 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  44.54 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
260 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  44.1 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.96 
 
 
245 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
231 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  41.52 
 
 
242 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  40.27 
 
 
252 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  39.46 
 
 
259 aa  178  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  39.29 
 
 
236 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
248 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  39.91 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
257 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
251 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
236 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  38.39 
 
 
236 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  38.22 
 
 
230 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  37.78 
 
 
238 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
232 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.84 
 
 
279 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  34.56 
 
 
230 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.28 
 
 
260 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  36.28 
 
 
260 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  36.28 
 
 
260 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  36.28 
 
 
260 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
262 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.87 
 
 
237 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>