176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0678 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  57.81 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  46.69 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.49 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 239 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 239 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.89 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.73 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 232 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  45.81 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.2 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.41 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  42.48 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  41.15 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.15 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  40.91 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.85 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  40.57 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  40.57 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  40.57 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  40.57 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  40.57 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  40.57 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.06 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  40.16 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  35.81 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.81 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 340 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 340 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  37.02 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.44 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.68 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.19 
 
 		 338 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4307  cyclic nucleotide-binding protein  37.28 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  32.5 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  32.5 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  34.91 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.78 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 231 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.11 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  32.9 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  34.35 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  34.05 
 
 		 236 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3860  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5594  hypothetical protein  33.19 
 
 		 238 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>