174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1130 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  98.5 
 
 
267 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  83.4 
 
 
244 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  82.98 
 
 
244 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  82.98 
 
 
244 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.53 
 
 
240 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  65.11 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.39 
 
 
243 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.28 
 
 
244 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.28 
 
 
239 aa  275  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
239 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.52 
 
 
239 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.52 
 
 
239 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.08 
 
 
239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  57.33 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.08 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.08 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.77 
 
 
239 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.77 
 
 
239 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.96 
 
 
239 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
238 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.47 
 
 
243 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.47 
 
 
243 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.47 
 
 
243 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.63 
 
 
238 aa  265  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  55.14 
 
 
344 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.69 
 
 
254 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  54.69 
 
 
269 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  54.69 
 
 
312 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  54.69 
 
 
269 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  54.69 
 
 
269 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  54.69 
 
 
269 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  54.69 
 
 
269 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
240 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  54.29 
 
 
269 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.04 
 
 
244 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.66 
 
 
232 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
245 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.66 
 
 
232 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
232 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.89 
 
 
250 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.87 
 
 
260 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.74 
 
 
246 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
268 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  50 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  51.11 
 
 
255 aa  238  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
340 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
242 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  54.46 
 
 
242 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.89 
 
 
236 aa  235  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.02 
 
 
340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.78 
 
 
239 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  53.12 
 
 
239 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  45.64 
 
 
439 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.34 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  48.66 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.55 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  46.43 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
255 aa  208  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
245 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.98 
 
 
246 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  38.98 
 
 
246 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  44.64 
 
 
234 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.89 
 
 
338 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.11 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  40.89 
 
 
238 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
262 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.03 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 
260 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 
260 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 
260 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.82 
 
 
279 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
248 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  40 
 
 
252 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  41.2 
 
 
259 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
260 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
260 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.27 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
258 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
236 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  38.26 
 
 
236 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  38.89 
 
 
230 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.21 
 
 
240 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
267 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
232 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>