194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3729 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  88.33 
 
 
243 aa  427  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.8 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.8 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.39 
 
 
244 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.7 
 
 
267 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.28 
 
 
267 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  60 
 
 
242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  52.17 
 
 
239 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.65 
 
 
238 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.51 
 
 
239 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.51 
 
 
239 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.89 
 
 
238 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.07 
 
 
239 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.07 
 
 
239 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
239 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 
239 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 
239 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.11 
 
 
254 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.77 
 
 
250 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.77 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
247 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
240 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.34 
 
 
236 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  48.44 
 
 
255 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.43 
 
 
232 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.98 
 
 
232 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
232 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  47.39 
 
 
255 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.11 
 
 
245 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.02 
 
 
246 aa  222  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
239 aa  221  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  48.23 
 
 
439 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  49.57 
 
 
242 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
340 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
242 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.04 
 
 
239 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.11 
 
 
340 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.8 
 
 
255 aa  208  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  47.35 
 
 
344 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  47.79 
 
 
269 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
260 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  47.79 
 
 
269 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  47.79 
 
 
269 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  47.79 
 
 
269 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  47.79 
 
 
269 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  47.79 
 
 
312 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
260 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  47.35 
 
 
269 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
263 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.69 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  43.81 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
255 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  44.64 
 
 
274 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.73 
 
 
246 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  39.73 
 
 
246 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.22 
 
 
338 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
239 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  40.53 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  40.89 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.78 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  37.78 
 
 
260 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  37.78 
 
 
260 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  37.78 
 
 
260 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
251 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  38.5 
 
 
252 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
262 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
236 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.17 
 
 
279 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
232 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
257 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
260 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
260 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  36.89 
 
 
230 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
269 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  36.89 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.16 
 
 
247 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0519  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
238 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.317582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>