178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3549 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.55 
 
 		 240 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 239 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 239 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  67.21 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 239 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 239 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.38 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.4 
 
 		 239 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  66.37 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  66.52 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  61.28 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.52 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.11 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 247 aa  284  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.67 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  59.47 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  59.03 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.93 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  54.81 
 
 		 439 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  55.17 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.02 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 255 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.9 
 
 		 236 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 340 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  50.21 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  50.64 
 
 		 312 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  50.21 
 
 		 269 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  50.21 
 
 		 269 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  50.21 
 
 		 269 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  50.21 
 
 		 269 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  50.21 
 
 		 269 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  49.79 
 
 		 269 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.66 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  47.77 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.77 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  45.41 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.1 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  44.92 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.92 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  42.49 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  39.56 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  40.47 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  39.73 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.15 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.67 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.87 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  37.87 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  37.87 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  37.87 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  39.04 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  38.22 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  39.11 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>