218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1880 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1880  regulatory protein Crp  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  82.06 
 
 		 263 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.34 
 
 		 253 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  59.75 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.75 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  59 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5519  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  0.190361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0645  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0252  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0555  transcriptional regulatory protein  44.98 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0885845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0654  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0432804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1183  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.3 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  42.29 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  42.48 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.28 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.4 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3464  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0401211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  38.94 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.2 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.34 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  35.34 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.96 
 
 		 236 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  35.84 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2486  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.82 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  33.79 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.11 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  34.78 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2958  cyclic nucleotide-binding  38.91 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  38.19 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.55 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4396  cyclic nucleotide-binding protein  35.45 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  34.04 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  34.67 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  31.72 
 
 		 439 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  33.77 
 
 		 236 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.19 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  31.91 
 
 		 344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  34.5 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  31.52 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  33.78 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  31.13 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.74 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>