179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3742 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  66.52 
 
 		 247 aa  327  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0519  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.67 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  37.72 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  37.73 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3375  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.08 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3900  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.81 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1880  regulatory protein Crp  42.48 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4763  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.22 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  32.6 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  36.73 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.73 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3274  cyclic nucleotide-binding  40.55 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.93 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.28 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.47 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.72 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  144  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5519  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  0.190361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 267 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2150  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0697428  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5594  hypothetical protein  37.33 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  32.89 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  32.89 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  32.89 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  32.89 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  32.89 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  32.89 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4396  cyclic nucleotide-binding protein  33.19 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  32.34 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  32.46 
 
 		 344 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  32.46 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  30.6 
 
 		 439 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.59 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  34.53 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  30.34 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  32.47 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 340 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 268 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.56 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.81 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>