147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0459 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0459  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 788 aa  1561    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.202007  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 1007 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 2490 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.64 
 
 		 589 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 627 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1714 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 616 aa  92.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  27.15 
 
 		 657 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 706 aa  90.9  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1085 aa  91.3  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  27.86 
 
 		 657 aa  90.9  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 3560 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 750 aa  88.2  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 569 aa  87.8  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 1106 aa  87.4  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 589 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 618 aa  86.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  28.61 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 		 699 aa  85.9  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 909 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  20.98 
 
 		 1252 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 3035 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 672 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 718 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 4489 aa  83.2  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  21.92 
 
 		 1252 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 		 529 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  28.35 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 654 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1094 aa  81.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1106 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 811 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.72 
 
 		 937 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  26.35 
 
 		 588 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  21.88 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  24.69 
 
 		 633 aa  77.4  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  27.05 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.31 
 
 		 864 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 574 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  26.6 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 754 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 633 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  20.68 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 717 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  22.28 
 
 		 745 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  26.13 
 
 		 452 aa  72  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 750 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 667 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  24.46 
 
 		 632 aa  69.7  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 740 aa  68.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  24.64 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 754 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 761 aa  68.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25.46 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  23.63 
 
 		 1221 aa  67.4  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  25.67 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 732 aa  67  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  25 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  25.06 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  19.15 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  21.28 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  21.28 
 
 		 731 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  25.53 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  20.11 
 
 		 1014 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  24.16 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 732 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  24.93 
 
 		 1144 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  19.86 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.68 
 
 		 837 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  28.73 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  25.62 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  22.03 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  23.18 
 
 		 1116 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 796 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 824 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 708 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  24.18 
 
 		 494 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.91 
 
 		 739 aa  56.2  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>