242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17611 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  98.72 
 
 		 390 aa  768    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 390 aa  776    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  62.21 
 
 		 390 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  58.51 
 
 		 392 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  53.83 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  53.47 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  52.19 
 
 		 392 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  52.19 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  52.94 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  44.73 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  45.13 
 
 		 385 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  46.63 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  44.7 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  44.7 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  42.71 
 
 		 413 aa  345  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  40.62 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.59 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 		 383 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  28.42 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  27.91 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  30.98 
 
 		 376 aa  179  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.98 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.79 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  28.23 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  28.28 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.23 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  28.28 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  28.21 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.67 
 
 		 384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.66 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  27.99 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.75 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  28.16 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  27.25 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  27.25 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.67 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  28.32 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.25 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  28.69 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  28.43 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  28.73 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  26.8 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  28.39 
 
 		 370 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.16 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  28.38 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  28.82 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  27.37 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  27.99 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  28.09 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 		 393 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  27.99 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  28.09 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  27.76 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  26.92 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  24.93 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  27.93 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  28.12 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  27.32 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  27.85 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  28.11 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  25.21 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  28.75 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  28.43 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  27.23 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  26.94 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  25.94 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  28.35 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  28.43 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  26.92 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  28.84 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  24.74 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  28.83 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  27.62 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  25.67 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  26.23 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>