240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2115 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 393 aa  765    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  80.66 
 
 		 393 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  73.52 
 
 		 392 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  59.79 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  52.94 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  52.94 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  47.18 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  46.41 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  46.92 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  51.67 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  45.88 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  46.29 
 
 		 385 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  47.81 
 
 		 385 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  45.9 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 413 aa  338  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  44.33 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  44.33 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.34 
 
 		 384 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 392 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  30.97 
 
 		 372 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  36.68 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.33 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.4 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.4 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.69 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.04 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.71 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  36.52 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  29.15 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  29.67 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  33.6 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  26.01 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.33 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  36.57 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  37.22 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.44 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  29.13 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  33.67 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.06 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  26.25 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.1 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  29.19 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  32.79 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  32.13 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  31.69 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  37.05 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  29.06 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  31.17 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  32.27 
 
 		 385 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  31.81 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  31.29 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  28.38 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  26.99 
 
 		 363 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>