245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4173 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  99.73 
 
 		 375 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  87.16 
 
 		 380 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  86.22 
 
 		 380 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  97.07 
 
 		 375 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  93.07 
 
 		 375 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 375 aa  747    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  84.95 
 
 		 376 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  78.67 
 
 		 378 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  80.48 
 
 		 378 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  78.75 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  72.85 
 
 		 380 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  57.94 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  56.42 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  54.52 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  54.67 
 
 		 385 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  54.93 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  54.93 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  54.26 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  54.69 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  54.67 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  53.7 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  54.79 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  54.69 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  55.88 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  52.91 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  55.61 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  53.37 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  53.74 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  51.59 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  54.01 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  52.82 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  51.48 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  54.01 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  53.99 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  53.97 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  54.28 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  50.66 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  53.74 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  49.74 
 
 		 389 aa  371  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  50.8 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 378 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  49.47 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  47.06 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  54.4 
 
 		 382 aa  348  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  47.07 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  45.7 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  50.26 
 
 		 419 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  48.53 
 
 		 388 aa  338  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 402 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  48.02 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  50.4 
 
 		 384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  47.76 
 
 		 385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  46.84 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  46.36 
 
 		 382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  48.02 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  49.47 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  50.66 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  48.67 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  44.15 
 
 		 385 aa  325  7e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  47.23 
 
 		 389 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  47.23 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  46.03 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  46.42 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  45.24 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  47.23 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  47.23 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  46.7 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 385 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  48.54 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  47.11 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  48.03 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  47.77 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  47.77 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  47.77 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  47.77 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  47.77 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  47.77 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  48.15 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  46.7 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  45.97 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>