261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3751 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  757    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  46.92 
 
 		 384 aa  348  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  44.56 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  43.73 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  43.24 
 
 		 380 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  44.17 
 
 		 372 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  43.77 
 
 		 389 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  43.75 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  42.93 
 
 		 384 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  44.92 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  43.36 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  37.33 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  37.05 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  38.17 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  40.55 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  36.56 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  36.56 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  42.16 
 
 		 410 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  40.22 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  39.36 
 
 		 378 aa  265  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  39.02 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  41.4 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  40.81 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  41.13 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  41.13 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  37.07 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.87 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  37.29 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.5 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 		 375 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  40.56 
 
 		 372 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.09 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  36.34 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.85 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  33.62 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  32.1 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  37.77 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.58 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.97 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  34.06 
 
 		 385 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  34.54 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.4 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 385 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  32.29 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  35.85 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  37.35 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  35.57 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  36.58 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  30 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 435 aa  209  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  36.06 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  34.72 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>