240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14951 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  78.06 
 
 
392 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
392 aa  791    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  76.53 
 
 
392 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  76.28 
 
 
392 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 
390 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 
390 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  48.45 
 
 
392 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  50.26 
 
 
390 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  47.31 
 
 
393 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  47.18 
 
 
393 aa  361  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  44.22 
 
 
399 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  41.19 
 
 
385 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  41.07 
 
 
413 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 
384 aa  322  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 
384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  35.57 
 
 
385 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 
363 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 
384 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  29.49 
 
 
384 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  28.93 
 
 
384 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  29.16 
 
 
379 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  29.35 
 
 
380 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 
379 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  27.69 
 
 
383 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  30.4 
 
 
380 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.16 
 
 
389 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  27.08 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  27.44 
 
 
383 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  27.44 
 
 
383 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  27.25 
 
 
386 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 
383 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
371 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 
367 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  31.98 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  28.94 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  30.2 
 
 
370 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  27.88 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  26.58 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  28.26 
 
 
383 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  28.99 
 
 
388 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  27.62 
 
 
376 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  28.13 
 
 
376 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 
379 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  27.32 
 
 
378 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  26.53 
 
 
377 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  27.55 
 
 
378 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  29.52 
 
 
380 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  28.09 
 
 
376 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  27.74 
 
 
402 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.37 
 
 
388 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  28.27 
 
 
385 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  27.76 
 
 
410 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  26.73 
 
 
380 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  27.81 
 
 
407 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  26.61 
 
 
377 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 
358 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  26.2 
 
 
389 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  27.91 
 
 
382 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  26.15 
 
 
379 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 
384 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  27.32 
 
 
385 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  25.26 
 
 
419 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  27.32 
 
 
385 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.16 
 
 
392 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  26.58 
 
 
382 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  28.16 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  24.43 
 
 
384 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  27.06 
 
 
385 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  28.03 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  27.06 
 
 
368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  25.87 
 
 
384 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  26.55 
 
 
384 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  26.8 
 
 
391 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  25.96 
 
 
388 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  26.01 
 
 
376 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  24.87 
 
 
402 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  25.9 
 
 
387 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
382 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
382 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  26.05 
 
 
379 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  27.27 
 
 
385 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  26.55 
 
 
380 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 
382 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 
388 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  26.79 
 
 
384 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
382 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  27.91 
 
 
382 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 
382 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  26.8 
 
 
375 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 
382 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 
382 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 
382 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 
382 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>