244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2535 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
382 aa  769    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  42.56 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 
383 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 
384 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 
384 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  39.25 
 
 
372 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  40.22 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  38.89 
 
 
380 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  38.5 
 
 
380 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 
383 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  37.78 
 
 
387 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 
388 aa  249  8e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 
376 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 
384 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.71 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 
402 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  39.48 
 
 
376 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  37.01 
 
 
378 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  39.68 
 
 
383 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  39.68 
 
 
383 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 
410 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 
380 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.33 
 
 
388 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  36.29 
 
 
380 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 
382 aa  225  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 
379 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
380 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.72 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 
378 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 
386 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 
383 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 
380 aa  219  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 
388 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  34.72 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32.97 
 
 
370 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  35.56 
 
 
384 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 
384 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 
389 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.35 
 
 
398 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 
419 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
383 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 
389 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 
376 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 
385 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.35 
 
 
392 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.35 
 
 
398 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  32.01 
 
 
368 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 
398 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 
382 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 
384 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  33.77 
 
 
385 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.33 
 
 
375 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 
385 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 
367 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 
379 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.98 
 
 
384 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.33 
 
 
375 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 
393 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.54 
 
 
392 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32.48 
 
 
370 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 
375 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 
382 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.95 
 
 
377 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 
380 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.93 
 
 
384 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 
379 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
383 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 
388 aa  203  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
379 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 
378 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 
375 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.1 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  32.66 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
385 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 
385 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.52 
 
 
383 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.29 
 
 
378 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
389 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  30.1 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
382 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
382 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
382 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>