261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0400 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  756    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  46.77 
 
 		 384 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  45.16 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  45.43 
 
 		 384 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  45 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  45.19 
 
 		 383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  43.8 
 
 		 380 aa  338  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  43.54 
 
 		 380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  45.14 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 		 388 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  43.72 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  43.28 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  41.45 
 
 		 411 aa  291  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 376 aa  291  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  42.37 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  38.74 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  38.22 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  40.49 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  38.8 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  39.78 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  41.87 
 
 		 377 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.87 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  40.33 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  38.25 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  41.18 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  40 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  38.57 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  40.6 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  39.71 
 
 		 375 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  40.33 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  39.48 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  38.26 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.66 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  35.69 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.89 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.19 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 		 385 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  34.12 
 
 		 376 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  36 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  32.7 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  40.5 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34.62 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  34.23 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  37.98 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  36.18 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  35.93 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  34.57 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.86 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32.8 
 
 		 370 aa  212  7e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.07 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 375 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  35.73 
 
 		 375 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  31.47 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.67 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.82 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1771  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.016286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  36.2 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>