269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2350 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  83.81 
 
 		 384 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  768    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  67.65 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  62.89 
 
 		 383 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  61.64 
 
 		 379 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  59.47 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  58.82 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  52.69 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  47.47 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  47.47 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  52.13 
 
 		 388 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  46.92 
 
 		 384 aa  348  8e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  45.71 
 
 		 384 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  41.36 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  39.01 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  46.58 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  38.74 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  43.43 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  43.21 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  38.58 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  38.48 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  39.11 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  39.53 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 378 aa  265  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  38.77 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  39.67 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  38.4 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  38.32 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  40.65 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  38.04 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  37.63 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  38.32 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  39.02 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  38.46 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 368 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.67 
 
 		 380 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 385 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  38.52 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  38.6 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  38.79 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  39.64 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 371 aa  248  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  37.77 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  36.65 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  39.37 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  36.62 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  40.96 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  42.32 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.67 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  39.37 
 
 		 384 aa  245  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  36.91 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.46 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  39.02 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  41 
 
 		 378 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  38.35 
 
 		 379 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  36.05 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 		 398 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  36.19 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  39.23 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  36.73 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  33.78 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  38.07 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  38.59 
 
 		 367 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  35.34 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  35.34 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  39.3 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>