257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1172 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 388 aa  768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  52.13 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  50.92 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  51.97 
 
 		 384 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  47.59 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  47.72 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  50.42 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  47.18 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  45.62 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  43.75 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  47.09 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 		 388 aa  318  7.999999999999999e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  44.92 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  38.19 
 
 		 384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 		 384 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  40.36 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  39.52 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  41.19 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  40.54 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  39.88 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  38.06 
 
 		 380 aa  250  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  35.86 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  37.77 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  37.5 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  39.04 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.85 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  33.78 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  41.19 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.7 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  37.84 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  38.2 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  38.11 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.08 
 
 		 380 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  36.23 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  36.29 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  33.7 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.92 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  37.28 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  36.26 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  35.51 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 398 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.05 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  34.05 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  35.51 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  37.71 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  36.89 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  37.61 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.26 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  33.71 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  37.31 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  39.88 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  38.71 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.35 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  37.13 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  37.14 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.64 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  36.55 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.64 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>