246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7057 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 367 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  56 
 
 		 371 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  57.65 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  57.1 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  51.66 
 
 		 376 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  52.62 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  47.81 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  44.81 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  40.37 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  38.59 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.59 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  38.25 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  34.5 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  35.69 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  34.5 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  36.56 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 382 aa  228  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36.26 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  34.41 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  34.41 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  37.31 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  34.07 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  34.79 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34.77 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.97 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  34.24 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  34.92 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  34.24 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.25 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  33.89 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 388 aa  195  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  33.42 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  33.7 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  34.21 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.58 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.41 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  35.04 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  32.44 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  31.87 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  34.82 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  31.62 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  34.91 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.51 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  34.89 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  32.04 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  34.81 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  33.87 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  31.39 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  32.04 
 
 		 390 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  31.62 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.36 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  31.87 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 384 aa  175  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>