240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0342 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 380 aa  768    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  66.05 
 
 		 380 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  65 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  62.63 
 
 		 382 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  58.84 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  56.35 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  58.42 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  39.27 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 379 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  37.07 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 376 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36.83 
 
 		 410 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.5 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  36.04 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  35.06 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  37.66 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.66 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.12 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  37.69 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.05 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.66 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.1 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  35.12 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32.45 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  34.61 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.25 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.32 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.1 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  33.82 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  29.86 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.96 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  34.54 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.4 
 
 		 388 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  31.77 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  34.11 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 392 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.1 
 
 		 380 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.76 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  32.75 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  31.41 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  31.59 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 379 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  33.91 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>