242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1224 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 411 aa  830    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  41.6 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  40.36 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  38.73 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  41.1 
 
 		 372 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  39.38 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  38.48 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  37.96 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  40.36 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.5 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  39.36 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  34.94 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  36.55 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  37.6 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  37.89 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  37.89 
 
 		 385 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.89 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  35.52 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  39.31 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 384 aa  227  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  38.78 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 379 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 384 aa  226  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  37.18 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  35.53 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  36.36 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.32 
 
 		 385 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  36.59 
 
 		 375 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.68 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 375 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  34.15 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  35.51 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  36.99 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.77 
 
 		 375 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  35.44 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  32.91 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  36.71 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  39.17 
 
 		 377 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  38.07 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1506  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  35.71 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  37.67 
 
 		 376 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  34.77 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  33.67 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  35.24 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  34.45 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  34.77 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  35.51 
 
 		 375 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  35.51 
 
 		 375 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  34.17 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.89 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  34.19 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  37.22 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>