242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0922 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 435 aa  899    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1506  lipid-A-disaccharide synthase  67.63 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  66.99 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  43.92 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  40.69 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 		 375 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  40.45 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 		 375 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  42.66 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  41.58 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  42.38 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 		 380 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  37.22 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  38.92 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  40.3 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  42.42 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  42.7 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  43.01 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  42.42 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  42.42 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  40.96 
 
 		 376 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  42.94 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  38.19 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  41.39 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  40.31 
 
 		 392 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  42.66 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  42.66 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  42.66 
 
 		 385 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  40.64 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 378 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.41 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  39.5 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  37.88 
 
 		 388 aa  256  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  37.07 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  37.22 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  39.27 
 
 		 383 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.94 
 
 		 386 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  39.39 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  38.67 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  38.96 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  39.6 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  36.23 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  39.34 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  38.59 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  39.09 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  39.17 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  38 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  39.72 
 
 		 377 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 382 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 382 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 382 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  38.53 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  33.17 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  37.96 
 
 		 382 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  39.15 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  35.32 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  37.78 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  36.32 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  39.34 
 
 		 384 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 382 aa  226  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  35 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  35.68 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  36.88 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  36.3 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  36.3 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  36.3 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  36.3 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  36.3 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.48 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  35.86 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.56 
 
 		 381 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>