247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1325 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
384 aa  786    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  96.88 
 
 
384 aa  763    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  38.74 
 
 
384 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  39.63 
 
 
387 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  38.32 
 
 
384 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  40.59 
 
 
383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 
384 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 
388 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  37.05 
 
 
384 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  38.89 
 
 
379 aa  278  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  38.23 
 
 
380 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  38.23 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  36.78 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  38.29 
 
 
384 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 
388 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 
376 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.33 
 
 
380 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 
380 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  38.34 
 
 
392 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 
419 aa  245  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  35.88 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  34.68 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  35.68 
 
 
389 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  36.03 
 
 
385 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  34.15 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  34.15 
 
 
375 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 
378 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  36.03 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  34.69 
 
 
375 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 
375 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.49 
 
 
388 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 
377 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 
388 aa  238  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  39.21 
 
 
380 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 
378 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.54 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 
376 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  36 
 
 
377 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  37.89 
 
 
375 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  37.89 
 
 
375 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 
392 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 
384 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 
385 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 
411 aa  226  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.79 
 
 
376 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 
386 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 
388 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  35.86 
 
 
385 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 
393 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 
388 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  35.97 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
398 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 
398 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 
380 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 
376 aa  219  8.999999999999998e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
398 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
382 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 
382 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 
382 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 
382 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 
382 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.6 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 
382 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  37.38 
 
 
367 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  216  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  37.74 
 
 
372 aa  215  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 
383 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  35.17 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  36.45 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  32.26 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 
378 aa  213  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 
377 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.8 
 
 
384 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 
385 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>