241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04825 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 370 aa  761    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  70.49 
 
 		 371 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  69.95 
 
 		 372 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  57.65 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  53.24 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  47.75 
 
 		 377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  49.59 
 
 		 378 aa  352  7e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  44.77 
 
 		 370 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  45.58 
 
 		 383 aa  307  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.7 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  38.17 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.95 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 387 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.9 
 
 		 386 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  33.97 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  34.5 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 383 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  34.5 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.01 
 
 		 380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.58 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  34.53 
 
 		 384 aa  215  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  37.07 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 392 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  30.62 
 
 		 384 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.48 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  33.86 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  35.61 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 		 379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.1 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  33.06 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  33.63 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  29.83 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.12 
 
 		 376 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  32.86 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.99 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  34.76 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>