259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2625 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
383 aa  740    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  97.65 
 
 
383 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  97.39 
 
 
383 aa  701    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  82.45 
 
 
377 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  45.23 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  43.43 
 
 
384 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  42.29 
 
 
392 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  43.85 
 
 
383 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  41.22 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  43.13 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  41.85 
 
 
380 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  41.55 
 
 
372 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  43.21 
 
 
388 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  40.5 
 
 
389 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  40.72 
 
 
383 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  48.49 
 
 
380 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  41.69 
 
 
385 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  41.69 
 
 
385 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  41.39 
 
 
385 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  41.3 
 
 
382 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 
381 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  45.5 
 
 
379 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  41.4 
 
 
384 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  42.02 
 
 
389 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 
385 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 
382 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  39.35 
 
 
379 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  40.34 
 
 
378 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  41.76 
 
 
389 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 
386 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  38.87 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  40.92 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  40.81 
 
 
384 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  39.45 
 
 
382 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  38.87 
 
 
398 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  40.79 
 
 
384 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  42.94 
 
 
390 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  41.64 
 
 
380 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  38.87 
 
 
392 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  38.87 
 
 
398 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  43.02 
 
 
388 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  38.75 
 
 
384 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  40.38 
 
 
377 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  41.48 
 
 
380 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 
388 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 
375 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  38.98 
 
 
393 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 
375 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 
411 aa  245  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  39.11 
 
 
393 aa  245  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  42.65 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  43.2 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  38.93 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  42.59 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  41.55 
 
 
389 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  41.55 
 
 
389 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  42.6 
 
 
375 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  39.17 
 
 
383 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  41.29 
 
 
389 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  41.29 
 
 
389 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  42.77 
 
 
378 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  39.56 
 
 
402 aa  242  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  40.17 
 
 
384 aa  242  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  40.54 
 
 
388 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  39.35 
 
 
380 aa  242  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  42.3 
 
 
376 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 
401 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  43.44 
 
 
377 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  42.31 
 
 
375 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  41.29 
 
 
389 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  40.79 
 
 
389 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  34.44 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  41.85 
 
 
389 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  41.08 
 
 
402 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  39.17 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  40.41 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  40.4 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  37.27 
 
 
376 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  42.18 
 
 
378 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  36.49 
 
 
388 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  33.87 
 
 
378 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  39.6 
 
 
380 aa  237  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  40.18 
 
 
419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  39.78 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>