249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1258 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 392 aa  791    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  53.08 
 
 		 384 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  50.66 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  51.23 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  49.21 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  47.48 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  41.82 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  42.29 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  47.09 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  43.61 
 
 		 384 aa  296  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  42.32 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 		 376 aa  292  7e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  42.02 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  42.02 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  40.27 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  38.79 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  38.36 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  35.95 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  38.03 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  38.78 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  39.44 
 
 		 376 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.77 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.95 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  39.05 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  40.31 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.6 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  38.12 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.45 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  35.86 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.51 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.29 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  35.36 
 
 		 379 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  34.57 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  37.35 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32.89 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  37.28 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  40.24 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  36.83 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  34.44 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.06 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  34.92 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  36.94 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  35.26 
 
 		 379 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  34.91 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.56 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  35.56 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.42 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  36.56 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  35.79 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  34.49 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.42 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  36.64 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  36.64 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  36.64 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  36.64 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  36.64 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.42 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.26 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.42 
 
 		 392 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>