242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1568 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 393 aa  807    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  60.99 
 
 		 382 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  59.68 
 
 		 385 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  60.32 
 
 		 385 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  60.1 
 
 		 385 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  59.63 
 
 		 382 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  60.05 
 
 		 385 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  59.47 
 
 		 398 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  58.89 
 
 		 383 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  59.47 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  58.62 
 
 		 384 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  57.7 
 
 		 384 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  59.2 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  59.47 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  57.37 
 
 		 380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  56.48 
 
 		 383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  58.06 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  54.18 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  54.99 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  52.42 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  52.42 
 
 		 382 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  53.35 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  52.42 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  52.42 
 
 		 382 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  52.42 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  52.42 
 
 		 382 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  52.15 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  51.6 
 
 		 382 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  50.39 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  50.53 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  50.53 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  52.97 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  50.26 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  53.19 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  52.29 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  49.61 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  49.61 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  53.39 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  49.61 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  50.66 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  49.2 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  50.66 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  47.89 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  48.54 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  49.34 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  50.95 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  48.26 
 
 		 382 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  51.08 
 
 		 376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  48.02 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 		 378 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  48.66 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  46.68 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  49.6 
 
 		 378 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  46.32 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  44.53 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  44.18 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  45.14 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  45.88 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  42.89 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  40.75 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  45.6 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  43.7 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  43.28 
 
 		 379 aa  298  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  42.82 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  41.78 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  43.24 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  43.39 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  41.78 
 
 		 385 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  42.02 
 
 		 389 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  42.86 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  40.73 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  41.05 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  41.53 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  42.11 
 
 		 389 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  42.11 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  42.11 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  41.84 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  41.84 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2572  lipid-A-disaccharide synthase  41.67 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126435  normal  0.026533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  42.49 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  42.51 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1451  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  41.53 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  42.11 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  41.15 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  40.73 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  40.69 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  40.69 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>