274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2261 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  83.81 
 
 		 384 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  67.92 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  62.89 
 
 		 383 aa  501  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  63.59 
 
 		 379 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  60.42 
 
 		 380 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  59.26 
 
 		 380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  53.17 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  53.08 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  50.92 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  44.41 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  44.41 
 
 		 376 aa  348  9e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  47.09 
 
 		 384 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  46.59 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  42.44 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  43.92 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  38.86 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  43.65 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  38.32 
 
 		 384 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  42.01 
 
 		 377 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 		 380 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 		 379 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  39.27 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  41.07 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  40.76 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  41.21 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  38.15 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.97 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  35.7 
 
 		 370 aa  256  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35.54 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.74 
 
 		 375 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 375 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  38.85 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  35.38 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  37.97 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  35.55 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  38.15 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.93 
 
 		 375 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  38.38 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  37.43 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  39.35 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  37.87 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  39.77 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  38.87 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  37.75 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  38.12 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  39.46 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  39.36 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  40.71 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  40.75 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  37.86 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  35.37 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  40.29 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  35.38 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  36.65 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  39.23 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  39.01 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  36.28 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  34.75 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.9 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.63 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  34.85 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  40.28 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>