245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0443 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 380 aa  777    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  70.79 
 
 		 380 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  65 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  65.79 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  64.21 
 
 		 382 aa  500  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  59.52 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  54.5 
 
 		 383 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  38.48 
 
 		 384 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 379 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.6 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  35.32 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  39.6 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.29 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.11 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  38.06 
 
 		 388 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.87 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.9 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  34.07 
 
 		 376 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  39.32 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  39.32 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  36.98 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  36.15 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.08 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  34.36 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.02 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.2 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  31.66 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  32.85 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.59 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 385 aa  185  9e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  34.57 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  31.46 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  33.25 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  27.89 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  29.84 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  30.49 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  30.14 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  30.96 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.68 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  30.4 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  30.9 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.66 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.66 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  30.25 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 		 396 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2087  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  29.77 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  32.44 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  31.98 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  29.86 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  27.63 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  27.93 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  28.9 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  32.37 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  28.73 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>