241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1432 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 392 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  88.52 
 
 		 392 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  89.8 
 
 		 392 aa  714    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  78.06 
 
 		 392 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  52.96 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  52.19 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  52.07 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  48.96 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  46.04 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  46.02 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  43.26 
 
 		 385 aa  338  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  41.45 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  39.85 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  41.49 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  41.97 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  41.97 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  28.75 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  27.6 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  27.65 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  28.73 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  27.53 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  27.81 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  25.97 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  29.64 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32.23 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  29.49 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  27.23 
 
 		 376 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  28.03 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  26.21 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  26.28 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.32 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  26.97 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  28.95 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.71 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  29.44 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  29.66 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  26.02 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  26.97 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  28.07 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  26.33 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  27.71 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  29.93 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  28.32 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.2 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  26.46 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 		 380 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  25.93 
 
 		 419 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  28.07 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  25.52 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  26.45 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  27.22 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  28.06 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  25.71 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  27.76 
 
 		 391 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  28.02 
 
 		 382 aa  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  25.68 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  27.53 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  27.11 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  25.94 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  27.11 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  26.72 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  28.95 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  26.37 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  26.76 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  24.81 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  25.64 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  26.11 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  26.11 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  26.11 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  24.49 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  27.92 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  27.68 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  27.74 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  26.79 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  27.51 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  25.97 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  26.6 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>