242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0558 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 393 aa  773    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  80.66 
 
 		 393 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  72.31 
 
 		 392 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  60.36 
 
 		 390 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  53.57 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  53.83 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  46.8 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  47.57 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  47.31 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  46.04 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  51.79 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  46.29 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  43.04 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  45.5 
 
 		 384 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  43.7 
 
 		 385 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  46.43 
 
 		 385 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  44.99 
 
 		 386 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  44.99 
 
 		 386 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.27 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 383 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.59 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  34.79 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34.79 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.41 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.85 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.36 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  35.52 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.2 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  36.55 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.37 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  33.5 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  28.83 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  31.81 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.64 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  31.17 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.81 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 379 aa  156  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  29.65 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  32.87 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  27.46 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  33.61 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.07 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.75 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  27.63 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  32.06 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  32.66 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  31.76 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  32.06 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  31.04 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  32.07 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.87 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  32.74 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  31.49 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>