240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13881 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 390 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  64.43 
 
 		 392 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  62.98 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  62.21 
 
 		 390 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  60.36 
 
 		 393 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  59.79 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  52.85 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  52.33 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  52.07 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  50.26 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  47.04 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  48.32 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  46.63 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  45.1 
 
 		 385 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  45.06 
 
 		 413 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  44.96 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  44.96 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 		 385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  31.62 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.49 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.12 
 
 		 388 aa  166  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.12 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  31.63 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.14 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  29.35 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  28.02 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  29.79 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.21 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 384 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 384 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.26 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  29.67 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  27.99 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  28.91 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  29.87 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  31.62 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  28.03 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  28.75 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  29.15 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  27.57 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  28.76 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  30.33 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  29.87 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  28.01 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  29.56 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  29.26 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  29.24 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  26.88 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  31.28 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  29.16 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>